기후동행카드는 2026년 9월을 기점으로 운영 방식에 큰 변화를 맞이했습니다. 정부의 전국 단위 대중교통비 지원 제도인 '모두의카드' 도입에 따라, 기존 기후동행카드는 '기후동행패스'로 전환되거나 운영이 종료되었습니다. 특히 선불 30일권은 9월 29일까지, 후불카드의 기존 할인 혜택은 9월 30일까지 적용되었으며, 단기권은 계속 운영됩니다. 이러한 변화는 시민들의 대중교통 이용 편의를 높이고 관리 체계를 일원화하기 위한 조치로 보입니다.
실사용자들은 기후동행카드 종류별로 종료일이 달라 혼란을 겪기도 했습니다. 특히 선불 30일권 이용자들은 8월 31일 충전이 종료되고 9월 29일까지 이용이 가능했으며, 후불카드 이용자들은 9월 30일까지 기존 할인 혜택을 받을 수 있었습니다. 또한, 4월부터 6월까지 기후동행카드를 이용한 서울시 및 연계 수도권 주민들은 최대 9만 원의 페이백 혜택을 받을 수 있었으나, 이는 자동 지급이 아니므로 직접 신청해야 하는 번거로움이 있었습니다.
기존 기후동행카드 실물카드는 10월 2일까지 현장 부스에서 새 기후동행패스 실물카드로 무료 교환이 가능했습니다. 교환 시에는 회원가입과 카드 등록까지 마쳐야 환급 혜택을 받을 수 있었으며, 점심시간을 피해 방문하는 것이 좋았습니다. 또한, 4~6월 사용분에 대한 페이백 신청은 9월 30일이 마감일이었으므로, 해당 기간 이용자들은 서둘러 신청 여부를 확인하는 것이 중요했습니다.